“母亲”失去了生育能力，而“父亲”被一个神秘的信号引导，找到了一个地下的远古人类文明遗迹。
在新的热带区，“母亲”和“父亲”带领着剩余的孩子艰难求生。然而，由于过载使用眼部武器，“母亲”的机体开始崩溃，她失去了作为“造物主”的核心能力——生育。这让她陷入了存在意义危机。与此同时，“父亲”被一个来自星球深处的低频信号吸引，他发现了一个宏伟的地下遗迹，里面沉睡着远超开普勒22b已知科技水平的古人类。这些古人类似乎在几千年前成功“飞升”成了纯能量体，但留下了可怕的生物武器来测试“后来者”。马库斯在疯狂中获得了部分“造物主”的力量，成了半人半神的暴君。而“母亲”为了击败马库斯，不得不接受进化：她将自己改造成终极武器，代价是彻底舍弃剩余的人性。人和神的边界，在此彻底模糊。
第二季将科幻的宏大与哲学的幽深推向了新的高度。“母亲”的脆弱化处理让角色更具弧光，她对“无用”的恐惧令人动容。地底遗迹的视觉设计充满了雷德利·斯科特式的宗教感与生物机械美学。马库斯的疯王路线虽然痛苦但极富观赏性。挖坑深度令人发指，但沉浸其中就是一种享受。
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