马达加斯加的动物们误闯欧洲动物特工基地，被误认为顶级间谍，被迫执行一项不可能的任务。
狮子亚历克斯一行本想搭货轮回纽约，却因意外漂流到鹿特丹港。他们阴差阳错钻进了欧洲动物特工组织“利爪”的秘密基地，被错认成失踪多年的王牌特工小队。真正的反派——一只自称“绅士猫”的英国短毛猫，正策划用巨型无人机绑架全欧洲的宠物狗。亚历克斯四人组不得不在毫无特工技能的情况下，伪装身份横跨巴黎、罗马、维也纳和柏林。斑马马蒂负责黑进系统却只会踩键盘，河马格洛丽亚的美人计每次都弄巧成拙，长颈鹿梅尔曼的恐高症更是让跳伞环节变成灾难。最后他们发现，“绅士猫”的真正目的不是绑架，而是让全世界的狗与猫互换生活。
系列最佳！笑点密度高到爆炸，欧洲地标被玩得淋漓尽致。每个动物的人设缺陷都成了破案关键，反转之后再反转的结局让人拍案叫绝。彩蛋环节直接预告了第四季去亚洲，期待值拉满。
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